Ziel des Biotopverbundes ist die Bewahrung und Wiederherstellung funktionsfähiger Wechselbeziehungen in der Landschaft. Die Wechselbeziehungen äußern sich im Austausch von Individuen zwischen Räumen. Durch den Biotopverbund wird der genetische Austausch und die Wiederbesiedlung nach lokalen Aussterbeereignissen gefördert. Der Biotopverbund gewährleistet darüber hinaus auch die Nutzung verschiedener Lebensraumtypen durch Arten, deren Ansprüche an den Lebensraum wechseln (z. B unterschiedliche Brut- und Jagdgebiete).

Die Biotopverbundplanung ist in den §20 und 21 des Bundesnaturschutzgesetzes als „Soll“-Bestimmung verankert und soll auch der Kohärenz des Natura2000-Schutzgebietssystems dienen. Der Biotopverbund ist Aufgabe verschiedener räumlicher Ebenen, insbesondere aber der Gemeinden. Das Instrument soll in Baden-Württemberg über das Naturschutzrecht gestärkt und künftig einen verpflichtenden Charakter erhalten.

Das ILN Südwest hat im Auftrag der Landesanstalt für Umwelt und Messungen (LUBW) für die Stadt Singen die Biotopverbundplanung modellhaft umgesetzt.

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